胆总管结石按病因可分为原发胆总管结石和继发胆总管。85％；的胆总管结石是继发性结石，是由胆囊内结石迁移至胆总管所致，其结石成分与胆囊结石相同，可为胆固醇性结石或胆色素性结石。原发性结石的形成与胆汁淤滞、细菌感染有关，结石多为松软、土样，可充满整个胆道。
胆总管结石可以通过超声多普勒超声检查、CT、MRI或MRCP、ERCP等检查明确。
有20％；的病人可以自发排石进入十二指肠，但在排石过程中可能是无症状或引起结石性肠梗阻或胰腺炎。而胆总管内驻留结石可能是无症状或引起胆总管梗阻（胆绞痛、黄疸）、胰腺炎、胆管炎或胆总管十二指肠空肠瘘等。
胆总管结石合并胆管炎可以出现发热、右上腹压痛、反跳痛及肌紧张；如合并胆总管完全梗阻可能出现重症急性胆管炎，病人可能会出现高热、休克及精神症状，如不及时治疗可能出现生命危险。化验检查可能出现白细胞总数及分类升高、胆红素、直接胆红素升高及肝功能损害等异常发现。
一旦发现胆总管结石大多需要治疗，治疗的目的是去除结石。
可以采用手术的方法如腹腔镜下胆管切开取石或腹腔镜下经胆囊管取石术，开腹或腹腔镜治疗胆总管结石可以保护好胆总管下端与胰管共同开口处的阀门――十二指肠乳头，可以有效减少术后十二指肠乳头出血、十二指肠漏、创伤性胰腺炎及远期可能发生的十二指肠乳头狭窄、肠液返流性胆管炎等较为严重的并发症。对一些不适合腹腔镜手术的病人则需要开腹胆管切开取石或经胆管囊取石术。对于胆囊结石所致的继发性胆总管结石则需要在治疗胆总管结石的同时行胆囊切除术。
目前多采用腹腔镜下胆囊切除+胆总管切开取石或经胆囊管取石术。高龄或不能耐受较长时间手术者也可采用先行内镜取石再行腹腔镜胆囊切除术或先行腹腔镜胆囊切除术再内镜取石术。有一点要强调的是多数情况下内镜可以取净胆总管内结石，但胆囊内结石内镜是无法取出的。
对于一些高龄或不能耐受手术者可采用内镜下胆管取石或介入下经皮经肝胆管穿刺引流、扩张取石术。继发性胆总管结石通过以上方法大多能治愈，而原发性胆总管结石术后复发率较高。
