除了对胃肠道及肾脏的副作用外，非甾体类抗炎药对其它器官电有一定的副作用。
有些非甾体类抗炎药可产生轻微的神经系统副作用，常见的症状有头痛;头晕、耳鸣、失眠、感觉异常等。在中毒时可出现谵妄、惊厥、昏迷等严重症状。非甾体类抗炎药对血液系统也有一定的影响，以粒细胞减少及再生障碍性贫血为最常见。
较大剂量的水杨酸制剂可抑制血小板的凝集，降低其相互粘附的能力，从而延长出血时间。在并存血管病变时往往可以诱发严重出血，尤以有脑血管病变者慎用。
使用人工心脏瓣膜或血管栓塞病人抗凝治疗时，非甾体类抗炎药应减量以预防大出血。有肝损害、维生素缺乏及手术前病人应慎用水杨酸类药。阿司匹林、消炎痛等非甾体类抗炎药可有肝损害，其常见症状为黄疽、转氨酶升高、恶心、呕吐等。另外，皮疹及过敏反应也不少见，严重的过敏反应甚至可导致哮喘及休克。如遇以上情况，应迅速送医院抢救。
